โรงเรียนคงทองวิทยามีการบริหารจัดการศึกษาโดยใช้นวัตกรรม KT SMART MODEL ในการจัดการศึกษา ภายใต้ระบบการกำกับติดตามของวงจรคุณภาพ PDCA ซึ่งได้แก่
ขั้นตอนที่ 1 การเตรียมการ (P)
การเตรียมการหรือการวางแผนเป็นขั้นตอนที่มีความสำคัญในการเตรียมพร้อมก่อนจะปฏิบัติตาม การบริหารด้านการจัดการศึกษา โดยสร้างความรู้ความเข้าใจกับผู้ที่เกี่ยวข้องให้มีความรู้ ความเข้าใจในส่วนประกอบต่าง ๆ ของรูปแบบการบริหารด้านการจัดการศึกษาโดยยึดแนวทางการในการปฏิบัติดังนี้
K = Knowledge ในการเตรียมการหรือวางแผนการปฏิบัติงาน ให้คณะครูและบุคลากรทางการศึกษานำองค์ความรู้ต่าง ๆ ข้อมูลสารสนเทศ มาสังเคราะห์เพื่อปรับใช้เป็นแนวการปฏิบัติการเพื่อให้เกิดการพัฒนาคุณภาพของการจัดการศึกษา
T = Team Work การประชุมวางแผนการทำงานผ่านคณะกรรมการดำเนินงาน ระดมการมีส่วนร่วมจากบุคลากรทั้งภายในและภายนอก วางแผนและข้อตกลงในการดำเนินงานร่วมกัน เพื่อให้การบรรลุเป้าหมายของโครงการ กิจกรรม ต่าง ๆ
ขั้นตอนที่ 2 การดำเนินงาน (D)
การดำเนินการของแต่ละโครงการ/กิจกรรม/งาน ยึดหลักการปฏิบัติดังนี้
S = Sufficiency คณะผู้บริหาร ครูและบุคลากรทางการศึกษา ยึดหลักความคุ้มค่าและความถูกต้องด้านงบประมาณในโครงการ/กิจกรรม/งาน โดยมีการเสนอขอใช้งบประมาณให้เป็นไปตามแผนปฏิบัติการประจำปี
M=Morality ยึดหลักความมุ่งมั่น ความรับผิดชอบ เห็นแก่ประโยชน์ส่วนรวม การประหยัด ความคุ้มค่าและการมีส่วนร่วมเป็นสำคัญ มีการเปิดรับฟังความคิดเห็นของผู้อื่นและผู้มีส่วนเกี่ยวข้อง ในระหว่างการดำเนินโครงการ/กิจกรรม/งาน
ขั้นตอนที่ 3 การประเมินผล (C)
การประเมินผลเป็นขั้นตอนหลังจากการดำเนินงานตามโครงการ/กิจกรรม/งาน เพื่อศึกษาผล การดำเนินงาน ความก้าวหน้าและการประเมินผล การดำเนินงาน ว่าผลการดำเนินงานเป็นอย่างไร สอดคล้องกับวัตถุประสงค์ของโครงการที่ตั้งไวเพียงไร เพื่อนำข้อมูลที่ได้จากการประเมินไปพัฒนาปรับปรุงการบริหารจัดการศึกษา ซึ่งยึดหลักการปฏิบัติดังนี้
A = Achievement มีการตั้งตัวชี้วัดความสำเร็จ วิธีการวัดและประเมินผล เครื่องมือที่ใช้ในการวัดและประเมิน ทุกโครงการโดยระบุไว้ในแผนปฏิบัติการประจำปี
ขั้นตอนที่ 4 การปรับปรุงพัฒนาอย่างต่อเนื่อง (A)
เป็นขั้นตอนที่นำเอาผลการประเมินมาวิเคราะห์ร่วมกันเพื่อให้ได้ข้อมูลสำคัญใน การปรับปรุงพัฒนาให้เกิดประสิทธิภาพ มีหลักการปฏิบัติดังนี้
R = Research มีการดำเนินการวิจัยเบื้องต้น เช่น การจัดทำแบบสำรวจความพึงพอใจในการดำเนินโครงการ/กิจกรรม/งาน จัดทำรายงานสรุปผลการดำเนินโครงการ/กิจกรรม/งาน
T = Technology มีการนำเทคโนโลยีมามีส่วนร่วมในจัดทำแบบสำรวจ แบบประเมินการเผยแพร่เอกสารรายงานผลการดำเนินโครงการ/กิจกรรม/งาน